Необходимо привести в порядок не очень красивый учет по НДФЛ, ЗУП 3.1, подробности в переписке

Есть организация с обособленными подразделениями, и неправильно заведены территории , без указания места нахождения налогового органа. В связи с этим итоговый отчет неправильно распределил налоги по подразделениям, нет равенства с полным сводом (отчетом) и данными в Предоставлении отчетности в ИНФС. 
Территории отменил, перепровел документы, стало покрасивее, но все же остались записи  в регистре  Учет доходов при исчисление НДФЛ, хотя после отмены территорий в учетной политике организации, строка с указанием территорий во всех документах пропала. Думаю обнулитьочистить указанный и регистр и заново провести документы, может тогда он корректно заполнится. 
Возможно есть другое решение, кто возьмется ?