Проверить файлы сайта на наличие стороннего кода, файл index.php. Убрать вредоносный код.

Сайт не работает. Ошибка 404. В поддержке сказали: Вам необходимо проверить файлы сайтов на наличие стороннего кода, нехарактерного для вашей CMS, 
а также наличие посторонних файлов среди файлов сайта. Проверьте, пожалуйста, файл index.php. В нем всё еще наблюдается подозрительный вирусный код. Ошибка 404 возникает на сайте из-за того, что у вас нет индексного файла. Пожалуйста, проверьте.
          Сайт у меня как запасной. Просто болтается в интернете. Но надо что бы он работал. Также есть брешь  в коде через который на почту валилось много спама через = консультации= или  =задать вопрос=. Забивался ящик быстро. 
Проверял внутренней программой в админке по поиску вирусов – он не обнаружил вируса.
Но сайт не виден в интернете.  Помогите . Скажите сколько стоит работа.