Департамент здравоохранения Воронежской области проводит государственную политику в сфере здравоохранения, включая вопросы организации медицинской профилактики, в том числе инфекционных заболеваний и СПИДа, медицинской помощи и медицинской реабилитации, фармацевтической деятельности. Основными задачами департамента являются участие в выработке и реализации государственной политики в области охраны здоровья населения Воронежской области, нормативно-правовое регулирование в сфере государственного здравоохранения и фармацевтической деятельности, охрана здоровья матери и ребенка, оказание специализированных видов медицинской помощи, организация системы профилактических мероприятий, медицинской помощи населению, медицинской реабилитации.