Анализ внутренней структуры сайта.
Анализ доступности целевых страниц сайта для поисковых систем.
Проверка наличие дублей страниц, текстов и заголовков.
Проверка контента на уникальность.
Проверка страниц на индексацию в поисковых системах.
Проверка сайта на склейку домена, спамные ссылки, скрытый текст итд.
Проверка страниц сайта на ошибки в HTML-коде.
Проверка сайта на возможное наличие сайтов-аффилиатов.
Проверка целевых точек входа на соответствие продвигаемым запроса.
Анализ ошибок в Google Webmaster и Яндекс Вебмастер.
Анализ внешней ссылочной массы сайта.
Рекомендации по внутренней оптимизации сайта, оформлению текстов, заголовков и мета-данных сайта.
И многое другое.