По договоренности
С Ftp автоматически скачиваются BAT-файлы в определённую папку (путь должен прописываться в настройках).
Нужно сделать программу, которая бы висела в трее, отслеживала появление этих вновь созданных BAT-файлов и запускала их.
BAT-файл после исполнения сценария сам себя удаляет. Но в дальнейшем он может появится вновь с таким же названием и его опять надо будет запускать.
Получается, что нельзя запускать одновременно несколько BAT-файлов. Нужно чтобы сначала один закончил работу, потом можно запускать следующий, если он есть.